上海海關是我國歷史最悠久的海關之一。自1685 年（清朝康熙 24 年）清政府在上海設置江海關開始計算，至今已有324年的歷史。1950年2月政務院發布命令，江海關更名為中華人民共和國上海海關。上海海關現設各類機構49個，包括辦公室、法規處、監管通關處、審單處、行郵處、加貿處、關稅處等20個內設職能處室（含緝私局），現場業務一處、二處、三處、駐郵局、車站辦事處等8個派駐機構，浦東、機場、吳淞、浦江、外高橋港區、洋山、外高橋保稅區等14個隸屬海關，以及全國海關進出口商品歸類中心上海分中心、海關總署上海商品價格信息處、中國電子口岸數據中心上海分中心等6個其他機構和駐上海世博會園區監管服務中心1個臨時機構，設立監管點共計275個。

上海海關堅持“依法行政，為國把關，服務經濟，促進發展”的海關工作16字方針和“政治堅強、業務過硬、值得信賴”的隊伍建設12字要求，以科學發展觀統領工作，以提高把關服務的能力和水平為主線，以深化改革、勇于創新為動力，以實施風險管理為中心環節，以基層建設為切入點，不斷推進現代海關制度第二步發展戰略，求真務實，開拓進取，勇于爭當全國海關現代化建設的排頭兵。